Sébastien Sauvé travaille, d’une part, sur la mobilité et la biodisponibilité des contaminants « dits traditionnels », tels le plomb ou le cadmium et, d’autre part, sur les composés d’intérêt émergent (médicaments, cyanotoxines et nanoparticules, par exemple). Ses travaux focalisent sur l’analyse des contaminants, leur spéciation chimique, leur devenir environnemental et leurs effets potentiels.