Professeur au département de chimie depuis 1974. En 1987, il a été nommé directeur du Département de chimie. En 1994, il devient vice-doyen, puis de 2001 à 2007, doyen de la Faculté des arts et des sciences. En 2007, il est nommé vice-recteur à la recherche, puis, en 2012, vice-recteur aux grands projets académiques jusqu’en 2013. Il a été nommé professeur émérite en 2014.

Menant une brillante carrière de professeur, de chercheur et de cadre académique, Joseph Hubert s’est illustré en s’engageant activement dans différents travaux de recherche sur les plans national et international. Au sein de son laboratoire et sous sa direction, les étudiants et les étudiantes à la maîtrise et au doctorat ont pu profiter des atouts de l’un des plus grands centres de formation en chimie analytique au Canada.

Il a aussi contribué à la réalisation de projets majeurs, dont la création de Calcul-Québec, de Calcul-Canada, du Centre sur la biodiversité de l’UdeM, du Centre interuniversitaire québécois de statistiques sociales et du Laboratoire international de recherche sur le Cerveau, la Musique et le Son. Il a également contribué au développement d’un grand nombre de regroupements stratégiques de recherche au Québec. De par son leadership, son sens de l’organisation et sa vision scientifique, Joseph Hubert a apporté une contribution remarquable au développement et à la promotion de la recherche scientifique au Québec et au Canada.